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楼主: 小圆

第13期“基因表达量计算与差异表达分析(上)”【视频】

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草履虫

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发表于 2017.8.11 11:42:21 | 显示全部楼层
请问TCGA数据库中的下载的counts是不是还要经过DEseq进行归一化处理才能用于后续的差异表达、聚类等分析?此外诸如网上下载的这类RNA数据(如下),请问它是基于什么算法对Counts值进行校正的啊?后续是不是就可以直接分析了?在线等,急!谢谢各位!

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  • TA的每日心情

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    发表于 2017.12.13 13:02:55 | 显示全部楼层
    手动mark下,很好的学习资料!
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    发表于 2017.12.22 11:55:15 | 显示全部楼层

    谢谢分享,太实用了
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  • TA的每日心情
    忙~
    5 小时前
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    发表于 2017.12.30 09:01:20 | 显示全部楼层
    谢谢分享
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  • TA的每日心情

    2018.10.17 21:18
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    发表于 2018.3.21 17:35:51 | 显示全部楼层
    谢谢分享,讲道理的话,怎么没有奥币啦。
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  • TA的每日心情
    忙~
    2018.8.26 11:46
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    发表于 2018.6.7 21:43:46 | 显示全部楼层
    请问DESeq输出的baseMean这个表达均值,是需要转换成FPKM才能绘制热图?
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  • TA的每日心情

    5 天前
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    发表于 2019.2.4 10:46:59 | 显示全部楼层
    DeG的基本入门统计知识,基础,counts数据是否加工后再用。
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