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[转录组] 多重相关检验中的相关系数r^2和p值该如何校正

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钵水母

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发表于 2016.1.26 17:26:59 | 显示全部楼层 |阅读模式

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我做了7个基因和500个转录因子间的相关 那么R值和p值取多少才是显著相关的
大家加油哇
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发表于 2016.1.26 18:08:35 | 显示全部楼层

相关系数强弱和P value

(1),在统计学上,一般认为 相关系数r^2的绝对值可以判断强弱。
一般认为:
0<|r^2|<0.3     弱相关或不相关
0.3 <|r^2|<0.6 中等强度的相关
0.6 <|r^2|        强相关

相关系数正负分别代表正相关和负相关;

(2)相关系数的显著性
当然,即使两组样本是完全随机的,也有一定的随机概率出现相关性。
所以我们需要通过统计学检验证明 r^2 ≠0。这个检验使用F检验,而且检验方法与一般线性回归的回归系数b≠0的显著性检验是等价的。


那么,每一次计算相关系数,都会对应一个p value。当然你这里有7个基因 和 500个转录因子,那么就产生了3500次检验,所以需要进行多重检验校正,计算FDR值。FDR的计算方法,可以参照论坛“在线交流”版块第11期的内容进行设计。
PS:晚饭吃了碳烤全羊,肚子一直撑到现在。






新的一天加油!
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钵水母

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 楼主| 发表于 2016.1.26 19:38:55 | 显示全部楼层
基迪奥-周煌凯 发表于 2016.1.26 18:08
沙发占楼,吃完晚饭再回复。

谢谢啦,在线等
大家加油哇
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宣传达人优秀版主


发表于 2016.1.27 09:25:17 | 显示全部楼层
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钵水母

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 楼主| 发表于 2016.1.27 09:35:16 | 显示全部楼层
基迪奥-周煌凯 发表于 2016.1.26 18:08
(1),在统计学上,一般认为 相关系数r^2的绝对值可以判断强弱。
一般认为:
0 ...

  好谢谢了
大家加油哇
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中华鲟

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发表于 2019.12.6 08:05:27 | 显示全部楼层
我是来看大神回复的
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中华鲟

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发表于 2019.12.6 08:06:59 | 显示全部楼层
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