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楼主: 小圆

第15期在线交流“本地Blast的使用方法”【视频】

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  • TA的每日心情
    害羞
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    发表于 2016.11.8 09:27:28 | 显示全部楼层
    小圆 发表于 2016.3.24 14:56
    本次在线交流的PPT下载:

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  • TA的每日心情
    no
    2018.11.19 23:07
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    发表于 2016.12.12 15:14:49 | 显示全部楼层
    谢谢了
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  • TA的每日心情

    2019.8.26 10:04
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    发表于 2016.12.29 21:37:47 | 显示全部楼层
    我今天才看到,估计也没人回答问题了,我想问下,如果数据库中那条序列,和我要往数据库里面比对的序列,相似度实在太低,导致默认情况下是没有比对的,我想问的是如何降低标准,算是它们比对上了。
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  • TA的每日心情
    yes!
    2019.2.11 09:53
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    发表于 2017.1.31 13:20:26 | 显示全部楼层
    请教一个问题,我用自己的转录组数据进行配置,进行搜索,如果是blastn,即核酸对核酸,没有结果;换成蛋白对蛋白,找到929个。
    问题1:虽然咱们设置的时候输出格式设定好了,不知道这929个搜索出来的序列,是否是按照从高到低的顺序排列的?我看匹配率并不是从高到低排列?还是只要看evalue就可以?
    问题2:因为是转录组数据中的unigene序列,那怎么提取出NCBI的同源序列?取几个啊?也有可能是基因家族,但是这结果也太多了。迷惑,望赐教,谢谢
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  • TA的每日心情

    2017.3.13 13:48
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    发表于 2017.2.19 22:16:15 | 显示全部楼层
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  • TA的每日心情
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    2019.6.27 20:57
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    发表于 2017.2.20 09:44:27 | 显示全部楼层
    我觉用着同源比对一直有个问题在困扰我,到底相似度多大才叫同源基因呢?
    往往我们做完这个比对,一个query会对应很多个比对,而从这些比对中再筛选结果是一个怎么样的过程。。?
    求指导。求打通
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  • TA的每日心情
    忙~
    2018.8.26 09:22
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    发表于 2017.5.29 10:28:41 | 显示全部楼层
    又是一篇好文
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  • TA的每日心情

    2019.2.11 13:58
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    发表于 2018.8.30 14:40:46 | 显示全部楼层
    逻辑思路 简单明了,一听就懂了。
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  • TA的每日心情

    2019.10.17 14:18
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    发表于 2019.10.28 16:08:05 | 显示全部楼层
    小圆 发表于 2016.3.24 14:56
    本次在线交流的PPT下载:

    讲解视频怎么看,下载不下来啊
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  • TA的每日心情

    2019.10.17 14:18
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    发表于 2019.10.28 16:08:58 | 显示全部楼层
    小圆 发表于 2016.3.24 14:56
    本次在线交流的PPT下载:

    您好,讲解视频怎么看,下载不下来啊,说是需要购买?
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  • TA的每日心情
    忙~
    2019.12.2 17:10
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    发表于 2019.10.28 18:00:02 | 显示全部楼层
    hanwei123 发表于 2019.10.28 16:08
    您好,讲解视频怎么看,下载不下来啊,说是需要购买?

    您好,讲解视频属于Omicshare课堂的付费课程,是不提供下载的
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  • TA的每日心情
    吃饭
    2020.3.17 16:18
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    发表于 2019.11.1 19:50:05 | 显示全部楼层
    感谢!
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  • TA的每日心情
    吃饭
    2020.3.17 16:18
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    发表于 2019.11.20 08:05:07 | 显示全部楼层
    感谢楼主分享
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  • TA的每日心情
    吃饭
    2020.3.17 16:18
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    [LV.6]常住居民II

    中华鲟

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    发表于 2019.11.20 08:09:07 | 显示全部楼层
    认认真真的学习~~~
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  • TA的每日心情

    2017.4.18 20:08
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    [LV.3]偶尔看看II

    钵水母

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    发表于 2019.12.6 08:37:03 | 显示全部楼层
    谢谢分享,讲得很好。
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